現代の犯罪都市ゴッサムシティの悪党たちがタイムスリップし、群雄割拠する戦国時代の日本。戦国大名となった悪党たちがこのまま自由に暴れ続ければ、日本だけでなく世界の歴史すらも変わってしまう! 絶望的な乱世で、現代テクノロジーからも切り離されてしまったヒーロー、バットマンは世紀の歴史改変を阻止することができるのか？日本と世界の未来をかけた、時空を超えた壮大なバトルの行方は！？

映画『ニンジャバットマン』は、犯罪都市ゴッサムシティの犯罪者たちが、戦国時代の日本にタイムスリップするという異色のストーリーを描く日本発のアニメーション作品。歴史改編を目論む最狂の愉快犯ジョーカーと、バットマンの戦いも描かれる。